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国立成育医療研究センター データサイエンス研修

 医療を含めた生命科学の多くの分野でもビッグデータを活用したディープラーニングなどの教師あり機械学習により人工知能の開発が進められています。国立成育医療研究センターでは2018年のAIホスピタル事業採択を機に、研究者、医師だけでなく全ての職員を対象としたデータサイエンスの啓蒙、教育活動を続けています。医療研究連携推進本部から支援を受け、2022年からは国立高度専門医療研究センターに属する6研究機関にまたがるオンライン研修となり、データサイエンス研修の方針をご理解いただける方ならばどなたでも参加できるよう門戸を広げています。

https://aihospital.ncchd.go.jp/ NCCHD データサイエンス研修 (NCCHD Data Science Seminar)

データサイエンス研修の方針

  • レベルを問わず自らテーマを見つけて自学自習し、仲間と情報共有する集まりです。
  • レベルの近い後進への積極的な助言を行なうことで成り立っている集まりです。
  • テキストチャットおよびウィキなどを利用した情報共有とその蓄積を重視しています。
  • 原則、参加メンバー間では姓ではなく名のさん付けで呼び合います。
  • 受け身な態度では決して習得できるものではないので、直接の指導は行っていません。
  • 各自の仕事内容や研究課題に対する相談を行う場は提供しません。
  • プロプラエタリなソフトウェアの扱いについては対象外としています。
  • 長期に渡って継続できるよう短時間で構わないので毎日時間を割いてください。
  • 一定期間、協力的な情報提供がない場合、無通告で集まりから外させていただきます。

現在の取り組み


プレゼンテーション

定例研修は2019年2月から毎週回を重ね、2024年2月で227回を数えます。現在では、参加メンバーが自主的に学んだことをオンラインでプレゼンテーションして情報共有する形で進めています。

教育用動画公開

定例研修で行われたプレゼンテーションは、質疑応答やディスカッションを経た上で、多くが動画収録され、センター内公開されます。これまで57動画が公開され、一部はICR臨床研究入門サイトから一般にも公開されています。

技術書会読

参加メンバーが希望者を募って読みたい技術書を選び、チームで読むペースを決めて会読を行なっています。週に1回程度オンラインで顔を合わせますが、主なコミュニケーションはテキストチャットです。

生命情報学コース

オンラインによるバイオインフォマティシャン育成コースです。ウェブサイトで検索した情報を利用しての自習、および自らプログラムを書いて動かしてみることが基本で、ウィキなどによる情報共有、参加メンバー間のテキストチャットで各自のスキルを高めます。

Foxglovetree

本研修では最初の取り組みとして、独自に顔写真を集め、また独自の方法でアノテーションを行い、笑顔などを判定するためのAIモデルをディープラーニングで作成しました。教育用にそのデータやスクリプトをFoxglovetreeデータセットとして公開しています。

トレーニングコース

国立成育医療研究センター研究所が病院医師のために実施している研究トレーニングコースのうち、再生医療センターが開講しているAI分野をデータサイエンス研修が担当しています。


沿革

Pythonプログラミング輪読

2016年7月1日から週に2回から1回 参加者5名程度 Python Programming for Biology

Deep learning勉強会

2017年2月7日から週1回 参加者 8名程度 全102回 ゼロから作るDeep Learning

顔写真収集の研究許可

2019年02月06日 倫理審査委員会 受付番号 2045

顔写真を判別するプログラム構築によるデータサイエンス研修

2019年2月22日 第1回データサイエンス研修を開催

データサイエンス研修オンライン

2020年4月13日 データサイエンス研修第63回から完全オンライン開催

顔写真収集の研究のデータセット公開

2020年4月24日 顔写真データセットFoxglovetreeをGitHubから一般公開

データサイエンス研修 第100回

2021年2月8日 データサイエンス研修 第100回 開催

顔写真収集の研究のリプリント公開

2021年10月16日 顔写真収集の研究のリプリント公開 bioRxiv 2020.10.14.337220

オンラインの技術書会読

2021年11月26日 技術書会読をオンラインで再開 ゼロから作るDeep Learning

生命情報学コース オンライン開講

2021年12月31日 バイオインフォマティシャン育成のための生命情報学コース開講

6NCデータサイエンス研修

2022年1月31日 データサイエンス研修6NCに門戸解放

顔写真収集の研究の論文発表

2022年3月8日 顔写真収集の研究がSci. Rep.誌に掲載

顔写真収集の研究のプレスリリース

2022年3月9日 顔写真収集の研究が国立成育医療研究センターよりプレスリリース

顔写真収集の研究のニュース配信

2022年8月18日 顔写真収集の研究が時事メディカルおよびYahoo!ニュースから一般向けに配信

データサイエンス研修 第200回

2023年4月10日 データサイエンス研修 第200回 開催




  • 最終更新:2024-02-18 11:32:13

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